Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lamc1P02468 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Lamc1P02468 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lamc1P02468 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms