Protein–RNA interactions for Protein: P01802

Ig heavy chain V-III region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01802 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01802 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01802 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01802 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01802 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01802 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01802 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01802 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01802 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01802 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01802 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01802 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01802 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01802 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01802 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01802 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01802 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01802 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01802 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01802 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01802 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01802 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01802 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01802 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01802 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01802 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01802 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01802 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01802 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01802 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01802 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01802 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01802 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01802 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01802 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01802 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01802 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01802 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01802 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01802 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01802 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01802 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01802 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01802 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01802 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01802 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01802 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01802 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01802 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01802 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01802 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01802 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01802 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01802 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01802 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01802 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01802 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01802 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01802 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01802 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01802 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01802 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01802 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01802 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01802 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01802 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01802 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01802 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01802 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01802 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01802 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01802 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01802 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01802 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01802 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01802 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01802 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01802 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01802 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01802 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01802 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01802 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01802 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01802 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01802 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01802 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01802 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01802 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01802 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01802 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01802 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01802 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01802 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01802 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01802 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01802 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01802 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01802 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01802 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01802 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms