Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpd52l1O54818 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpd52l1O54818 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpd52l1O54818 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tpd52l1O54818 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tpd52l1O54818 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpd52l1O54818 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms