Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad7O35253 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad7O35253 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad7O35253 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad7O35253 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad7O35253 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad7O35253 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad7O35253 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad7O35253 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad7O35253 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad7O35253 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad7O35253 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad7O35253 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad7O35253 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad7O35253 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad7O35253 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad7O35253 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad7O35253 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad7O35253 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad7O35253 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad7O35253 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad7O35253 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad7O35253 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad7O35253 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad7O35253 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad7O35253 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad7O35253 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad7O35253 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad7O35253 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.1 ms