Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm21976J3QNN2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21976J3QNN2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms