Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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