Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt2E9PUL5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt2E9PUL5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms