Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scn7aB1AYL1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scn7aB1AYL1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scn7aB1AYL1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156 ms