Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms