Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Six6Q9QZ28 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Six6Q9QZ28 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms