Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fscn3Q9QXW4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms