Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cml5Q9QXS8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cml5Q9QXS8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms