Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herpud1Q9JJK5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herpud1Q9JJK5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herpud1Q9JJK5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herpud1Q9JJK5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Herpud1Q9JJK5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herpud1Q9JJK5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herpud1Q9JJK5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herpud1Q9JJK5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herpud1Q9JJK5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herpud1Q9JJK5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herpud1Q9JJK5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herpud1Q9JJK5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herpud1Q9JJK5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herpud1Q9JJK5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Herpud1Q9JJK5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Herpud1Q9JJK5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Herpud1Q9JJK5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms