Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rsph3bQ9DA80 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph3bQ9DA80 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph3bQ9DA80 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms