Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pfn4Q9D6I3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pfn4Q9D6I3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms