Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9D5Q8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D5Q8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms