Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q5

Serpinb3b, MCG21235, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb3bQ9D1Q5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Serpinb3bQ9D1Q5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms