Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rnf17Q99MV7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rnf17Q99MV7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rnf17Q99MV7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141 ms