Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Spire2Q8K1S6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Spire2Q8K1S6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spire2Q8K1S6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms