Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdcl3Q8BVF2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcl3Q8BVF2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms