Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pja2Q80U04 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pja2Q80U04 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pja2Q80U04 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pja2Q80U04 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pja2Q80U04 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pja2Q80U04 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pja2Q80U04 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pja2Q80U04 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.1 ms