Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Med16Q6PGF3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med16Q6PGF3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240.8 ms