Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smchd1Q6P5D8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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