Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Thsd7aQ69ZU6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Thsd7aQ69ZU6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms