Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup62Q63850 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup62Q63850 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms