Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prdm1Q60636 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prdm1Q60636 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms