Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mdc1Q5PSV9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Mdc1Q5PSV9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Mdc1Q5PSV9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Mdc1Q5PSV9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mdc1Q5PSV9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mdc1Q5PSV9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mdc1Q5PSV9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Mdc1Q5PSV9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mdc1Q5PSV9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mdc1Q5PSV9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mdc1Q5PSV9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mdc1Q5PSV9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mdc1Q5PSV9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mdc1Q5PSV9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms