Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ulk3Q3U3Q1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms