Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VrtnQ3SYK4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.7 ms