Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samd11Q1RNF8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd11Q1RNF8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms