Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf9Q07105 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms