Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sox12Q04890 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Sox12Q04890 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sox12Q04890 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms