Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Epha4Q03137 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Epha4Q03137 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Epha4Q03137 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms