Protein–RNA interactions for Protein: P70188

Kifap3, Kinesin-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifap3P70188 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kifap3P70188 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Kifap3P70188 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kifap3P70188 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kifap3P70188 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kifap3P70188 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kifap3P70188 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kifap3P70188 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kifap3P70188 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Kifap3P70188 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kifap3P70188 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kifap3P70188 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kifap3P70188 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kifap3P70188 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.6 ms