Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa11P50709 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa11P50709 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa11P50709 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa11P50709 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa11P50709 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa11P50709 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa11P50709 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa11P50709 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa11P50709 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa11P50709 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa11P50709 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa11P50709 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa11P50709 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa11P50709 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa11P50709 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms