Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmod1P49813 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmod1P49813 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms