Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Epb41P48193 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb41P48193 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb41P48193 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Epb41P48193 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb41P48193 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epb41P48193 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.3 ms