Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kif3aP28741 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kif3aP28741 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif3aP28741 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms