Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fgf4P11403 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fgf4P11403 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms