Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NclP09405 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NclP09405 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NclP09405 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NclP09405 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NclP09405 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NclP09405 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NclP09405 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NclP09405 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NclP09405 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NclP09405 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NclP09405 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NclP09405 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NclP09405 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NclP09405 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NclP09405 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NclP09405 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NclP09405 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NclP09405 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NclP09405 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NclP09405 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NclP09405 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NclP09405 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NclP09405 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NclP09405 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NclP09405 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NclP09405 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NclP09405 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NclP09405 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NclP09405 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NclP09405 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NclP09405 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NclP09405 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NclP09405 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NclP09405 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NclP09405 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NclP09405 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NclP09405 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NclP09405 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NclP09405 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NclP09405 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NclP09405 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NclP09405 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NclP09405 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NclP09405 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NclP09405 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NclP09405 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NclP09405 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NclP09405 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NclP09405 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NclP09405 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NclP09405 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NclP09405 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NclP09405 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NclP09405 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NclP09405 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NclP09405 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NclP09405 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NclP09405 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NclP09405 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NclP09405 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NclP09405 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NclP09405 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NclP09405 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NclP09405 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NclP09405 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NclP09405 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NclP09405 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NclP09405 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NclP09405 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NclP09405 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NclP09405 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NclP09405 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NclP09405 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NclP09405 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NclP09405 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NclP09405 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NclP09405 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NclP09405 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NclP09405 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NclP09405 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NclP09405 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NclP09405 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NclP09405 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NclP09405 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NclP09405 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NclP09405 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NclP09405 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NclP09405 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NclP09405 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NclP09405 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NclP09405 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NclP09405 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NclP09405 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NclP09405 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NclP09405 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NclP09405 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NclP09405 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NclP09405 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NclP09405 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms