Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sypl2O89104 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sypl2O89104 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms