Protein–RNA interactions for Protein: O88737

Bsn, Protein bassoon, mousemouse

Predictions only

Length 3,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BsnO88737 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BsnO88737 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsnO88737 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsnO88737 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsnO88737 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsnO88737 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsnO88737 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsnO88737 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsnO88737 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsnO88737 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsnO88737 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsnO88737 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsnO88737 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsnO88737 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsnO88737 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsnO88737 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsnO88737 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsnO88737 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsnO88737 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsnO88737 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsnO88737 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsnO88737 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BsnO88737 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsnO88737 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsnO88737 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsnO88737 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsnO88737 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsnO88737 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsnO88737 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsnO88737 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsnO88737 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsnO88737 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsnO88737 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BsnO88737 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsnO88737 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsnO88737 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsnO88737 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsnO88737 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsnO88737 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsnO88737 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsnO88737 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsnO88737 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsnO88737 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsnO88737 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsnO88737 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsnO88737 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsnO88737 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsnO88737 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BsnO88737 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BsnO88737 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BsnO88737 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BsnO88737 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BsnO88737 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BsnO88737 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BsnO88737 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BsnO88737 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BsnO88737 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BsnO88737 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BsnO88737 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BsnO88737 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BsnO88737 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BsnO88737 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsnO88737 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsnO88737 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsnO88737 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsnO88737 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsnO88737 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsnO88737 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsnO88737 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsnO88737 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsnO88737 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsnO88737 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsnO88737 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsnO88737 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsnO88737 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsnO88737 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsnO88737 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BsnO88737 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BsnO88737 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BsnO88737 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BsnO88737 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BsnO88737 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BsnO88737 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BsnO88737 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BsnO88737 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BsnO88737 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BsnO88737 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BsnO88737 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BsnO88737 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsnO88737 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsnO88737 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsnO88737 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsnO88737 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsnO88737 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsnO88737 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsnO88737 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsnO88737 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsnO88737 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsnO88737 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BsnO88737 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms