Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb10O35955 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms