Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem200cJ3QK46 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem200cJ3QK46 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms