Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
2610001J05RikF2Z3Y9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2610001J05RikF2Z3Y9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 218.3 ms