Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdh18E9Q9Q6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdh18E9Q9Q6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh18E9Q9Q6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms