Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PtprbB2RU80 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprbB2RU80 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms