Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
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