Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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