Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a4Q9QZR9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a4Q9QZR9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a4Q9QZR9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a4Q9QZR9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a4Q9QZR9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Col4a4Q9QZR9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col4a4Q9QZR9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col4a4Q9QZR9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col4a4Q9QZR9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col4a4Q9QZR9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col4a4Q9QZR9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Col4a4Q9QZR9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col4a4Q9QZR9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col4a4Q9QZR9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col4a4Q9QZR9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col4a4Q9QZR9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col4a4Q9QZR9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col4a4Q9QZR9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Col4a4Q9QZR9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Col4a4Q9QZR9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col4a4Q9QZR9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Col4a4Q9QZR9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms